睡莲的种子成熟后,并不立即脱落,而是浮在水面上,由于水温和光照等因素影响,引起种皮破裂,然后自行沉入水底。种子的形状像椭圆形或卵圆形的坚果,长约2.5毫米～3毫米,外表包有一层白色蜡质,即为假种皮。果实成熟时,大部分种子开始发芽,但也有相当数量的种子不能发芽,这些种子叫做“不发芽的种子”。
种子外围具有由外胚乳变成的硬壳,里面含有丰富的营养物质,叫做“内胚乳”,是供给种子萌发时所需要的营养物质的。因此,可以说,没有完全发育的胚就没有种子,只有已经发育了的胚才能产生种子。